Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ITPA-205ENST00000460676 488 ntTSL 310.71□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 318.22■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 219.62■□□□□ 0.732e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 511.88□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CCDC57-214ENST00000582040 330 ntTSL 316.33■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 37.3
GTF2F1P35269 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.191e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.151e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-208ENST00000537354 450 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 512.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 323.77■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 216.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 37.2
GTF2F1P35269 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 420.82■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 218.17■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-211ENST00000589642 568 ntTSL 318.03■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-214ENST00000590450 573 ntTSL 415.69■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 514.9□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-202ENST00000416574 987 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-212ENST00000589834 591 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-206ENST00000587374 480 ntTSL 413.47□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-210ENST00000589241 557 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-218ENST00000593002 610 ntTSL 412.73□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 WBP2-217ENST00000592802 574 ntTSL 211.22□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-49■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 HK2-203ENST00000472302 395 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 37.1
GTF2F1P35269 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.93e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-216ENST00000592102 1976 ntTSL 226.28■■□□□ 1.83e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-207ENST00000587786 2343 ntTSL 1 (best)26■■□□□ 1.753e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-210ENST00000589362 1830 ntTSL 225.64■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-219ENST00000592824 1708 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 37
GTF2F1P35269 PPP2R2D-203ENST00000472664 770 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-24■■■■■ 37
GTF2F1P35269 PPP2R2D-206ENST00000517472 573 ntTSL 34.23□□□□□ -1.735e-24■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 223.83■■□□□ 1.414e-8■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EML2-215ENST00000588308 2062 ntTSL 221.8■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 37
GTF2F1P35269 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 37
GTF2F1P35269 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.15■□□□□ 0.349e-10■■■■■ 37
GTF2F1P35269 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.732e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-204ENST00000419132 506 ntTSL 325.14■■□□□ 1.622e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-205ENST00000419917 793 ntTSL 324.38■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-209ENST00000451404 992 ntTSL 324.2■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-206ENST00000423934 933 ntTSL 524.09■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-208ENST00000439597 854 ntTSL 324.09■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-207ENST00000430147 1030 ntTSL 318.67■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-212ENST00000484617 478 ntTSL 318.01■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 SLC2A8-214ENST00000489239 859 ntTSL 317.79■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.983e-9■■■■■ 36.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 86.7 ms