Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC2P35250 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC2P35250 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC2P35250 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC2P35250 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC2P35250 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC2P35250 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC2P35250 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC2P35250 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC2P35250 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC2P35250 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms