Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL1P33121 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms