Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFNP31947 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFNP31947 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFNP31947 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFNP31947 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFNP31947 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFNP31947 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFNP31947 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFNP31947 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFNP31947 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFNP31947 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFNP31947 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFNP31947 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFNP31947 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms