Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPS1P31327 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPS1P31327 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPS1P31327 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPS1P31327 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPS1P31327 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPS1P31327 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CPS1P31327 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPS1P31327 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPS1P31327 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPS1P31327 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CPS1P31327 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPS1P31327 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPS1P31327 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPS1P31327 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPS1P31327 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPS1P31327 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPS1P31327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CPS1P31327 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPS1P31327 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPS1P31327 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPS1P31327 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPS1P31327 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPS1P31327 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPS1P31327 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPS1P31327 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPS1P31327 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPS1P31327 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPS1P31327 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CPS1P31327 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPS1P31327 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPS1P31327 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPS1P31327 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPS1P31327 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPS1P31327 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPS1P31327 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPS1P31327 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CPS1P31327 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CPS1P31327 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPS1P31327 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms