Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBL1P28749 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBL1P28749 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBL1P28749 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBL1P28749 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBL1P28749 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBL1P28749 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBL1P28749 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBL1P28749 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBL1P28749 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBL1P28749 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBL1P28749 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBL1P28749 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBL1P28749 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms