Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB5P28074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms