Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMLP26374 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMLP26374 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMLP26374 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMLP26374 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMLP26374 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMLP26374 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMLP26374 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMLP26374 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMLP26374 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMLP26374 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMLP26374 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMLP26374 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMLP26374 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMLP26374 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMLP26374 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMLP26374 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMLP26374 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMLP26374 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms