Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YY1P25490 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YY1P25490 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
YY1P25490 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
YY1P25490 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YY1P25490 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YY1P25490 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
YY1P25490 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YY1P25490 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YY1P25490 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YY1P25490 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YY1P25490 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YY1P25490 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YY1P25490 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YY1P25490 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YY1P25490 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YY1P25490 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YY1P25490 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YY1P25490 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YY1P25490 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YY1P25490 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
YY1P25490 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms