Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRM1P23921 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRM1P23921 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRM1P23921 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRM1P23921 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRM1P23921 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRM1P23921 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRM1P23921 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRM1P23921 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRM1P23921 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRM1P23921 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRM1P23921 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRM1P23921 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRM1P23921 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRM1P23921 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRM1P23921 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRM1P23921 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRM1P23921 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRM1P23921 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRM1P23921 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRM1P23921 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRM1P23921 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms