Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4BP23588 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms