Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
S100A1P23297 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
S100A1P23297 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
S100A1P23297 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
S100A1P23297 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
S100A1P23297 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
S100A1P23297 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
S100A1P23297 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms