Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR3P22607 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR3P22607 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms