Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MATN1P21941 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MATN1P21941 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MATN1P21941 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MATN1P21941 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MATN1P21941 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MATN1P21941 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MATN1P21941 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MATN1P21941 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MATN1P21941 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MATN1P21941 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MATN1P21941 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MATN1P21941 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms