Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTNP21246 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTNP21246 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTNP21246 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTNP21246 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTNP21246 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTNP21246 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTNP21246 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTNP21246 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTNP21246 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTNP21246 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTNP21246 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms