Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA5P20719 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA5P20719 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms