Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB1P20700 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB1P20700 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB1P20700 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMNB1P20700 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LMNB1P20700 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMNB1P20700 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms