Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms