Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI1P19237 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms