Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCP1P17987 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCP1P17987 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCP1P17987 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCP1P17987 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCP1P17987 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCP1P17987 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCP1P17987 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCP1P17987 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCP1P17987 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCP1P17987 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCP1P17987 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms