Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOT1P17174 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOT1P17174 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOT1P17174 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOT1P17174 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOT1P17174 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOT1P17174 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOT1P17174 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOT1P17174 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOT1P17174 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOT1P17174 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOT1P17174 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms