Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STMN1P16949 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STMN1P16949 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STMN1P16949 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STMN1P16949 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STMN1P16949 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STMN1P16949 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STMN1P16949 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMN1P16949 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms