Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms