Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFXP16104 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFXP16104 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms