Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF3P15923 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF3P15923 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF3P15923 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF3P15923 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF3P15923 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms