Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD46P15529 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD46P15529 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD46P15529 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD46P15529 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD46P15529 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD46P15529 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD46P15529 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD46P15529 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CD46P15529 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD46P15529 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD46P15529 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms