Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA1P15085 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA1P15085 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA1P15085 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA1P15085 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA1P15085 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA1P15085 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA1P15085 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPA1P15085 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPA1P15085 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA1P15085 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA1P15085 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA1P15085 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA1P15085 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA1P15085 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA1P15085 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA1P15085 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA1P15085 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CPA1P15085 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CPA1P15085 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA1P15085 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms