Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNT1P13805 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms