Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA4P13612 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA4P13612 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms