Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD8P13378 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms