Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms