Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIP12755 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIP12755 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIP12755 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIP12755 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIP12755 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIP12755 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIP12755 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIP12755 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIP12755 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIP12755 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIP12755 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIP12755 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIP12755 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIP12755 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIP12755 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIP12755 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKIP12755 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKIP12755 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms