Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYH3P11055 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYH3P11055 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH3P11055 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH3P11055 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH3P11055 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH3P11055 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYH3P11055 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYH3P11055 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYH3P11055 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH3P11055 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH3P11055 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH3P11055 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH3P11055 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYH3P11055 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYH3P11055 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYH3P11055 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYH3P11055 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH3P11055 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH3P11055 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH3P11055 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYH3P11055 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYH3P11055 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYH3P11055 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms