Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGFB3P10600 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGFB3P10600 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms