Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAAP10253 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAAP10253 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAAP10253 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAAP10253 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAAP10253 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GAAP10253 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAAP10253 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GAAP10253 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GAAP10253 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GAAP10253 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GAAP10253 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GAAP10253 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GAAP10253 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAAP10253 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms