Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNHG28P0DPA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SNHG28P0DPA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms