Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR29P0C7W0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR29P0C7W0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms