Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47B1P0C2W7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CT47B1P0C2W7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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