Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBK3P0C264 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK3P0C264 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms