Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C4AP0C0L4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms