Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MGPP08493 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MGPP08493 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MGPP08493 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MGPP08493 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MGPP08493 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MGPP08493 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MGPP08493 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MGPP08493 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms