Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNP07948 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNP07948 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNP07948 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNP07948 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNP07948 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNP07948 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNP07948 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNP07948 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNP07948 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNP07948 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNP07948 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNP07948 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNP07948 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNP07948 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNP07948 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNP07948 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms