Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLK3P07288 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLK3P07288 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLK3P07288 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLK3P07288 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLK3P07288 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLK3P07288 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLK3P07288 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLK3P07288 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLK3P07288 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms