Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFMP07197 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEFMP07197 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEFMP07197 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEFMP07197 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFMP07197 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEFMP07197 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEFMP07197 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEFMP07197 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NEFMP07197 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms