Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK1P06493 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK1P06493 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK1P06493 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK1P06493 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK1P06493 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK1P06493 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK1P06493 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK1P06493 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms