Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFIP05156 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFIP05156 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFIP05156 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFIP05156 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFIP05156 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFIP05156 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFIP05156 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFIP05156 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFIP05156 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFIP05156 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFIP05156 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFIP05156 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFIP05156 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFIP05156 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms