Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPN1P04843 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPN1P04843 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPN1P04843 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPN1P04843 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPN1P04843 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPN1P04843 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPN1P04843 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPN1P04843 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPN1P04843 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPN1P04843 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPN1P04843 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPN1P04843 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPN1P04843 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPN1P04843 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPN1P04843 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPN1P04843 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPN1P04843 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPN1P04843 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPN1P04843 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPN1P04843 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPN1P04843 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPN1P04843 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms