Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTA1P02549 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms