Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRBV12-3P01733 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms