Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms